築50年の階段型壁式鉄筋コンクリ―ト造5階建ての中古マンションの1階を購入して全面リフォームを検討しています。
1階の床構造は木造となっていまして、一部が腐っていました。この木造の床は専有部でしょうか、それとも共有部でしょうか。共有部であれば管理組合の費用で修繕すべきと思いますが如何でしょうか。
また2階の排水管が1階の天井スラブ下を通っていますがこれは誰のものでしょうか。

2階の専有排水管が階下の天井を通っている個所は、裁判では共用部と解釈する判例で確定しています。
よって、維持管理責任は、管理組合にあるといえます。
床構造ですが、明確な規定が明示されている訳ではありませんが、床仕上げ材は専有部に該当するとの判断に問題はないと思います。この床下が、個人が専有できて自由に改装することには疑問がありますので、その下地材は共有部と考えるべきではないかと思います。
正確には管理規約などをご確認下さい。